本會自1997年成立至今，一直持續不斷地從事各項研究調查工作，各項調查皆由志工共同完成，且大多數研究調查並未有資金贊助，而是出自於志工的無私付出，實為可貴。學會目前進行有多項長期與主題性研究調查，研究調查結果則由學會志工進行分析，並撰寫成各項學術專文公開發表，並於網站上公告，提供有興趣的民眾自由下載。另外，針對目前全球各地標放的一百餘隻黑面琵鷺標記個體，本會亦持續進行觀察和記錄，並與香港、大陸及韓國相關的黑面琵鷺研究單位及個人，進行資料的分享與共製，相關訊息可參閱標記黑面專區。
長期鳥調97年度第四季調查時程表
長期鳥類調查95年度第四次檢討會
黑面琵鷺保護區環文蛤密度之調查
黑面琵鷺保護區內花身雞魚生長情形之探討
七股黑面琵鷺保護區魚類資源調查（碩士論文）
黑面琵鷺保護區內魚蝦蟹物種數與環境因子之相關性
澳洲大堡礁觀光宣傳折頁行銷及環境解說資訊之初探
2006~2007台南地區黑面琵鷺普查結果
長期鳥調96年度第二季調查時程表
2007春季三寶普查通知
