本會自1997年成立至今，一直持續不斷地從事各項研究調查工作，各項調查皆由志工共同完成，且大多數研究調查並未有資金贊助，而是出自於志工的無私付出，實為可貴。學會目前進行有多項長期與主題性研究調查，研究調查結果則由學會志工進行分析，並撰寫成各項學術專文公開發表，並於網站上公告，提供有興趣的民眾自由下載。另外，針對目前全球各地標放的一百餘隻黑面琵鷺標記個體，本會亦持續進行觀察和記錄，並與香港、大陸及韓國相關的黑面琵鷺研究單位及個人，進行資料的分享與共製，相關訊息可參閱標記黑面專區。
七股黑面琵鷺保護區與水域環境魚類資源調查99年度結果報告
七股黑面琵鷺保護區與水域環境魚類資源調查92至94年度結果報告
七股黑面琵鷺保護區魚類資源調查96至97年度結果報告
2008&2009年黑面琵鷺全球同步普查報告
長期鳥調98年度第三季調查時程表
2008~2009台南地區黑面琵鷺普查結果
2009年黑面琵鷺保護區環文蛤之調查
2009年黑面琵鷺全球同步普查結果
2008黑面琵鷺保護區高灘地環文蛤分佈之調查
2009年全球黑面琵鷺普查台灣區結果報告
